敦煌种业（600354）主营农作物制种和棉花收购加工业务。是我国第三大制种企业和最大的外贸制种基地，是全国最大的玉米，是甘肃省最大的棉花收购、加工企业。公司两大产业目前拥有5大专业基地。
受产量降低、出口减少、库存下降影响，世界范围玉米供给减少；而下游饲料业、工业用玉米需求量快速增长，玉米价格走势持续攀高。玉米价格刺激种子需求，总体看种子供求形势依然严峻，但优质良种供不应求，这将有利于拥有优质玉米种子的公司获得发展空间。公司引进的先锋良种是玉米行业的黄金标准，随着郑单958的逐渐没落，先锋良种必将异军突起。预计07年合资公司将获得投资收益800万美元，到2010年达到4800万美元。公司拥有全国三分之一的棉花产地资源。随着棉加工产业链条的逐渐完整，高毛利的棉产品比重增加。同时受益于棉价上涨和成本费用的有效控制，公司棉花业务毛利率有提高的趋势，总体看，棉花业务将保持稳定。与西班牙合作的番茄粉项目有望成为新的利润增长点。
渤海证券分析师陈慧认为，公司摆脱历史包袱，业绩爆发在即。参股的创新类券商东海证券，将使公司获得稳定增长的投资收益。预计06-08年每股收益分别为0.067、0.29、0.41元。合理价值10.25-11.72元，给予“强烈推荐”的投资评级。
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